História
Japoatã e Pacatuba trocaram de lugar ao longo do século XX, e vale seguir a história pelo lado de cá. A Lei estadual nº 583, de 23 de novembro de 1910, elevou o lugar a vila com a denominação de Jaboatão, desmembrando-o de Pacatuba — mas com uma peculiaridade registrada pelo IBGE: a sede do novo município continuou sendo a povoação de Pacatuba. Só em 20 de outubro de 1926, pela Lei estadual nº 960, a sede municipal foi transferida da antiga povoação de Pacatuba para a de Jaboatão, e o município passou a ter dois distritos. Em 31 de dezembro de 1943 veio a troca de nome: o Decreto-lei estadual nº 377, revogado pelo Decreto nº 533 de 7 de dezembro de 1944, fez de Jaboatão o Japoatã de hoje e transformou o distrito de Pacatuba em Pacatiba. A separação definitiva chegou pela Lei estadual nº 525-A, de 25 de novembro de 1953, que desmembrou o distrito e o devolveu à condição de município. Desde então o território de Japoatã é constituído apenas do distrito sede. A camada mais antiga é religiosa: uma missão fundada no lugar Riacho do Meio para catequizar o cacique Pocatuba e sua gente, com igreja dedicada a Nossa Senhora das Agonias, cuja imagem seguiu para Roma em 1630 por ordem do Vaticano — depois disso a povoação ficou consagrada a Nossa Senhora do Desterro.